研究成果（久保田耕平）
学位論文
久保田耕平 (1993) オサムシ亜族Carabina (Coleoptera, Carabidae)における分布域形成過程と雑種形成に関する考察. 148pp.（東京大学）
原著論文
82. Sasakawa K., Kim J.-L., Kim J.-K., Kubota K. (2017) Morphological phylogeny and biogeography of the Pterostichus raptor species group (Coleoptera: Carabidae) of ground beetles, endemic to the Korean Peninsula and adjacent islands. Journal of Asia-Pacific Entomology, 20: 7-12.
81. Park Y. H., Won D. S., Jang T. W., Chae H. M., Kim J. H., Kubota K., Kim J. K. (2015) Community structure and distribution og ground beetles (Coleoptera: Carabidae) in Baekdudaegan Mountain, Gangwon-do, Korea. Forest Science and Technology, 11: 153-159.
80. 鷲見勇貴・逢沢峰昭・久保田耕平・大久保達弘（2015）宇都宮大学船生演習林のオサムシ科甲虫群集の多様性．宇都宮大学演習林報告, 51: 1-8.
79. Shibuya S., Kikvidze Z., Toki W., Kanazawa Y., Suizu T., Yajima T., Fujimori T., Mansournia MR., Sule Z., Kubota K., Fukuda K. (2014) Ground beetle community in suburban Satoyama - A case study on wing type and body size under small scale management. Journal of Asia-Pacific Entomology, 17: 775-780.
78. 佐藤里沙・逢沢峰昭・久保田耕平・渋谷園実・大久保達弘（2014）北関東の落葉採取林と未採取林のオサムシ科甲虫群集．日本森林学会誌, 96: 141-145．
77. Karasawa S., Kanazawa Y., Kubota K. (2014) Redefinitions of Spherillo obcurus (Budde-Lund, 1885) and S. dorsalis (Iwamoto, 1943) (Crustacea: Oniscidea: Armadillidae), with DNA markers for identification. Edaphologia, 93: 11-27.
76. Jmbo K., Kubota K., Kikvidze Z. (2013) Ground beetle succession on Mount Fujisan. Biogeography, 15: 85-94.
75. Sasakawa K., Kim J. L., Kim J. K., Kubota K. (2013) New distribution record of Pterostichus taebaegsanus Nemoto, 1988 (Coleoptera: Carabidae). Biogeography, 15: 63-65.
74. Sasakawa K., Kim J. L., Kim J. K., Kubota K. (2013) Notes on the ground beetle Pterostichus togyusanus (Coleoptera: Carabidae): Phylogenetic evidence for species status and new distribution record. Journal of Asia-Pacific Entomology 16: 429-431.
73. Tanahashi M., Kubota K. (2013) Utilization of the nutrients in the soluble and insoluble fractions of fungal mycelium by larvae of the stag beetle, Dorcus rectus (Coleoptera: Lucanidae). European Journal of Entomology, 110: 611-615.
72. Kubota K., Miyazaki K., Ebihara S., Takami Y. (2013) Mechanical reproductive isolation via divergent genital morphology between Carabus insulicola and C. esakii with implications in species coexistence. Population Ecology, 55: 35-42.
71. 久保田耕平・久保田典子 ・永幡嘉之・乙部宏(2010) 近畿地方北部におけるトウカイコルリクワガタ近畿亜種とニシコルリクワガタ基亜種（コウチュウ目，クワガタムシ科）の分布. 日本生物地理学会会報 , 66: 7-16.
70. 神保克明・久保田耕平・ザール キクビツェ (2011) 富士山の一次遷移過程の異なる環境における地表性甲虫群集とその季節変動. 日本生物地理学会会報 , 66: 7-16.
69. Kubota K., Nagahata Y., Ikeda H., Kubota N., Otobe H., Umetsu K. (2011) Diversification process of stag beetles belonging to the genus Platycerus Geoffroy (Coleoptera: Lucanidae) in Japan based on nuclear and mitochondrial genes. Entomological Science, 14: 411-427.
68. Shibuya S., Kubota K., Osawa M., Kikvidze Z. (2011) Assembly rules in ground beetles: what decides comunity structure, environmental factors or competition? European Journal of Entomology, 108: 453-459.
67. Kubota K., Kubota N (2011) Gene flow between two closely related species in the acuticollis species group (Coleoptera, Lucanidae, genus Platycerus) near their distribution border based on the morphology and mitochondrial gene. Entomological Science, 14: 198-202.
66. 久保田耕平・久保田典子 (2010) タカネルリクワガタPlatycerus sue（コウチュウ目，クワガタムシ科）の飛来樹種. 日本生物地理学会会報 , 65: 189-191.
65. 久保田耕平・久保田典子 (2010) 京都府北部におけるコルリクワガタ種群the acuticollis species group（コウチュウ目，クワガタムシ科）の分布. 日本生物地理学会会報 , 65: 159-161.
64. 久保田耕平・久保田典子・乙部宏 (2010) 「絶滅のおそれのある野生動植物の種の保存に関する法律」にもとづく緊急指定種，タカネルリクワガタPlatycerus sue（コウチュウ目，クワガタムシ科）のミトコンドリア遺伝子の多様性. 日本生物地理学会会報, 65: 151-158.
63. Nishikawa M., Ikeda H., Kubota K., Sota T. (2010) Taxonomic redefinition and natural history of the endemic silphid beetle Shilpha longicornis (Coleoptera: Silphidae) of Japan, with an analysis of its geographical variation. Zootaxa, 2648: 1-31.
62. Ujiie M., Ishikawa R., Kubota K. (2010) Geographical variation of Carabus (Ohomopterus) esakii Csiki, 1927 (Coleoptera Carabidae) in Japan. Biogeography, 12: 53-64.
61. Kubota K. (2010) Discovery of Carabus (Ohomopterus) dehaanii Chaudoir, 1848 (Coleoptera, Carabidae) from the Ôsumi Peninsula, Kyushu, Japan: description of a new subspecies. Biogeography, 12: 49-52.
60. Toki W., Kubota K. (2010) Molecular phylogeny based on mitochondrial genes and evolution of host plant use in the long-horned beetle tribe Lamiini (Coleoptera: Cerambycidae) in Japan. Environmental Entomology 39: 1336-1343.
59. Ikeda H., Kubota K., Kagawa A. and Sota T. (2010) Diverse diet compositions among harpaline ground beetle species revealed by mixing model analyses of stable isotope ratios. Ecological Entomology 35: 307-316.
58. Tanahashi M., Kubota K., Matsushita N. and Togashi K. (2010) Discovery of mycangia and associated xylose-fermenting yeasts in stag beetles (Coleoptera: Lucanidae). Naturwissenschaften 97: 311-317.
57. Sasakawa K. and Kubota K. (2009) Phylogeny of ground beetles subgenus Nialoe (s. lat.) Tanaka (Coleoptera: Carabidae; genus Pterostichus): A molecular phylogenetic approach. Entomological Science 12: 308-313.
56. Ikeda H., Kubota K., Cho Y.-B., Lian H. and Sota T. (2009) Different phylogeographic patterns in two Silpha species (Coleoptera: Silphidae) affected by climatic gradients and topography. Biological journal of the Linnean Society 98: 452-467.
55. Kubota K., Kubota N., Otobe H. and Nagahata Y. (2009) A morphological phylogeny of the genus Platycerus (Coleoptera, Lucanidae) in Japan. Biogeography, 11: 57-72.
54. Nagata N., Kubota K., Takami Y. and Sota T. (2009) Historical divergence of mechanical isolation agents in the ground beetle Carabus arrowianus as revealed by phylogeographic analyses. Molecular Ecology, 18: 1408-1421.
53. Shibuya S., Kubota K. and Osawa M. (2008) Effect of small-scale management on biodiversity of an abandoned coppice forest in Japan: a case study on vegetation regeneration and ground beetle community. Web Ecology, 8: 116-124.
52. Ikeda H., Honma K. and Kubota K. (2008)Ground-dwelling beetle community in beech forests of Sado Island: comparison with the mainland. Journal of Forest Research, 13: 357-364.
51. Shibuya S., Kubota K., Kikvidze Z. and Osawa M. (2008) Differential sensitivity of ground beetles, Eusilpha japonica and Carabidae, to vegetation disturbance in an abandoned coppice forest in central Japan. Eurasian Journal of Forest Research, 11: 61-72.
50. Kubota K., Kubota N. and Otobe H. (2008) A revision of Platycerus acuticollis Y. Kurosawa (Coleoptera: Lucanidae) and its closely related species. Biogeography, 10: 79-102.
49. Ikeda H., Kagaya T., Kubota K. and Abe T. (2008) Evolutionary relationships among food habit, loss of flight, and reproductive traits: Life history evolution in the Silphinae (Coleoptera: Silphidae). Evolution, 62: 2065-2079.
48. Sasakawa K., Kim J. L., Kim J. K., Kubota K. (2008) Taxonomic studies on Pterostichus ishikawai Nemoto (Coleoptera: Carabidae). Entomological Science, 11: 173-178.
47. Sasakawa K., Kim J. L., Kim J. K., Kubota K. (2008) Notes on Morphodactyla ishikawai (Coleoptera, Carabidae): Recent records and preliminary data on the breeding type. Elytra, 36: 203-204.
46. Nagata N., Kubota K., Yahiro K. and Sota T. (2007) Mechanical barriers to introgressive hybridization revealed by mitochondrial introgression patterns in Ohomopterus ground beetle assemblages. Molecular Ecology, 16:4822-4836.
45. Kubota K., Kubota N., Akita K. and Otobe H. (2007) The easternmost record of Figulus punctatus (Coleoptera, Lucanidae) in Honshu and its host woody materials. Biogeography, 9: 77-82.
44. Toki W. and Kubota K. (2007) Male genital structures of longicorn beetle in the genus Mesechthistatus (Coloeptera, Cerambycidae, Phrissomini). Biogeography, 9:71-75.
43. Sasakawa K., Kim J. L., Kim J. K., Kubota K. (2007) Description of two new species of the subgenus Nialoe Tanaka, 1958 (Coleoptera: Carabidae; genus Pterostichus) from Mt. Jirisan, South Korea. Biogeography, 9: 57-61.
42. Sasakawa K. and Kubota K. (2007) Utility of external morphometrics for cryptic species identification: A case study of two species in Poecilus ‘samurai’ (Coleoptera, Carabidae). Applied Entomology and Zoology, 42: 353-365.
41. Nagata N., Kubota K. and Sota T. (2007) Mitochondrial phylogeography and introgressive hybridization of the ground beetles Carabus yamato in Japan based on mitochondrial gene sequences. Zoological Science, 24:465-474.
40. Sasakawa K. and Kubota K. (2007) Phylogeny and genital evolution of carabid beetles in the genus Pterostichus and its allied genera (Coleoptera: Carabidae) inferred from two nuclear gene sequences. Annals of the Entomological Society of America, 100:100-109.
39. Ikeda H., Kubota K., Kagaya T. and Abe T. (2007) Flight capabilities and feeding habits of silphine beetles: are flightless species really ‘carrion’ beetles?. Ecological Research, 22:237-241.
38. Ikeda H., Kubota K., Kagaya T. and Abe T. (2006) Niche differentiation of burying beetles (Coleoptera: Silphidae: Nicrophorinae) in carcass use in relation to body size: estimation from stable isotope analysis. Applied Entomology and Zoology, 41:561-564.
37. Sasakawa K. and Kubota K. (2006) Phylogenetic studies of the subgenus Petrophilus Chaudoir (Coleoptera: Carabidae: Pterostichus), with description of a new species sympatric with P. thunbergi Morawitz. Zootaxa, 1357:31-43.
36. Sasakawa K., Kim J. L., Kim J. K., Kubota K. (2006) Descriptions of two new species of Pristosia (Coleoptera: Carabidae) from South Korea. Annals of the Entomological Society of America, 99:1006-1011.
35. Zhang A. B., Kubota K., Takami Y., Kim J. L., Kim J. K. and Sota T. (2006) Comparative phylogeography of three Leptocarabus ground beetle species in South Korea based on mitochondrial COI and nuclear 28S rRNA gene. Zoological Science, 23:745-754.
34. Sasakawa K. and Kubota K. (2006) Nebria tenuicaulis sp. nov., a sympatric species with Nebria sadona ohdaiensis Nakane, with studies on the phylogeny of the subgenus Sadonebria Ledoux & Roux (Coleoptera: Carabidae). Zootaxa, 1306:41-50.
33. Yamashita H., Kiritani K, Togashi K. and Kubota K. (2006) Wing dimorphism of carabid beetles with special reference to Hemicarabus tuberculosus (deJean et Boisduval) and Cymindis daimio Bates (Coleoptera: Carabidae). Applied Entomology and Zoology, 41:463-470.
32. Sasakawa K., Kim J. L., Kim J. K., Kubota K. (2006) Geographical differentiation of “Pterostichus audax (Tschitscherine, 1985)" in South Korea with descriptions of four new species. Biogeography, 8:17-23.
31. Ikeda H., Honma K. and Kubota K. (2006) Body sizes of carabid beetles in Sado Island compared with the mainland. Biogeography, 8: 11-16.
30. Usami T., Yokoyama J., Kubota K. and Kawata M. (2006) Genital lock-and-key system and premating isolation by mate preference in carabid beetles (Carabus subgenus Ohomopterus). Biological Journal of the Linnean Society, 87:145-154.
29. Ujiie M., Kubota K., Sota, T. and Ishikawa R. (2005) Parallel formation of hybrid swarms of the ground beetles Carabus (Coleoptera: Carabidae) in adjacent river basins. Entomological Science, 8:429-437.
28. Sasakawa K. and Kubota K. (2005) Cryptic species of the subgenus Morphnosoma Lutshnik (Coleoptera: Carabidae; genus Pterostichus) from Japan. Entomological Science, 8:389-404.
27. Zhang A. B., Kubota K., Takami Y., Kim J. L., Kim J. K. and Sota T. (2005) Species status and phylogeography of two closely related Coptolabrus species (Coleoptera: Carabidae) in South Korea inferred from mitochondrial and nuclear gene sequences. Molecular Ecology, 14:3823-3841.
26. Ikeda H., Honma K. and Kubota K. (2005) Biotic and abiotic factors affecting the structure of ground invertebrate communities in Japanese cedar dominant forests. Eurasian Journal of Forest Research, 8:1-13.
25. 久保田耕平・市橋甫・内田孝（2004）伊勢湾を渡るミカワオサムシCarabus arrowianus（コウチュウ目，オサムシ科）. 日本生物地理学会会報，59:31-39.
24. Kubota K. and Ishikawa R. (2004) Geographical differentiation of Leptocarabus (Leptocarabus) kumagaii Kimura & Komiya in Honshu, Japan (Coleoptera, Carabidae). Biogeography, 6:27-38.
23. 久保田耕平・久保田典子 (2004) ヤナギ類（Salix spp.）の枯死部に穿孔するDorcus属（コウチュウ目，クワガタムシ科）. 樹木医学研究，8:17-22.
22. 久保田耕平・宝山・井上重紀 （2003）中国寧夏回族自治区におけるAnoplophora属2種（コウチュウ目，カミキリムシ科）の種間関係に関する形態学的解析. 樹木医学研究，7:77-82.
21. Kubota K. and Yahiro K. (2003) Description of an isolated and specialized population of Carabus arrowianus (Breuning, 1934) (Coleoptera, Carabidae) discovered in the southernmost part of Mie Prefecture, Japan, as a new subspecies, with analyses of its morphological features. Biogeography, 5:9-15.
20. Shoda E., Kubota K. and Makihara H. (2003) Geographical structure of morphological characters in Semanotus japonicus (Coleoptera: Cerambycidae) in Japan. Applied Entomology and Zoology, 38:369-377.
19. Shoda E., Kubota K. and Makihara H. (2003) Geographical structuring of mitochondrial DNA in Semanotus japonicus (Coleoptera: Cerambycidae). Applied Entomology and Zoology, 38:338-345.
18. Kobayashi T. and Kubota K. (2002) A revision of male adult Ablabesmyia (Diptera: Tanypodinae: Chironomidae) from Japan, with a description of A. prorasha new species, and a key to adult male species of the genus. Raffles Bulletin of Zoology, 5:317-326.
17. Kubota K., Kim J.-K. and Lee C.-Y. and Furuta, K. (2001) Ground beetle fauna in Pinus densiflora forests in Yangyang-gun, Kangwon Province, with special reference to outbreaks of the pine needle gall-midge (Thecodiplosis japonensis). Journal of Korean Forestry Society, 90: 632-642.
16. Sota T., Takami Y., Kubota K., Ujiie M. and Ishikawa R. (2000) Interspecific body size differentiation in species assemblage of the carabid subgenus Ohomopterus in Japan. Population Ecology, 42:279-291.
15. Sota T., Kusumoto F. and Kubota K. (2000) Consequences of hybridization between Ohomopterus insulicola and O. arrowianus (Coleoptera, Carabidae) in a segmented river basin: parallel formation of hybrid swarms. Biological Journal of the Linnean Society, 71: 297-313.
14. Sota T., Takami Y., Kubota K. and Ishikawa R. (2000) Geographic variation in the body size of some Japanese Leptocarabus species (Coleoptera, Carabidae): the "toppled-domino pattern" in species along a geographic cline. Entomological Science, 3:309-320.
13. 久保田耕平・李チャンヤン・金鍾國 (2000) 韓国江原道のアカマツ林における地表性無脊椎動物群集−特にマツバノタマバエの被害に関連して−. 森林文化研究，21: 137-146.
12. 久保田耕平 (1998) 東京大学演習林田無試験地におけるオサムシ科昆虫の季節変化−特に繁殖季節について−. 東京大学農学部演習林報告, 100:1-11.
11. Sota T. and Kubota K. (1998) Genital lock-and-key as a selective agent against hybridization. Evolution, 52:1507-1513.
10. Kubota K. and Sota T. (1998) Hybridization and speciation in the carabid beetles of the subgenus Ohomopterus (Coleoptera, Carabidae, genus Carabus). Researches on Population Ecology, 40:213-222.
9. 中嶋健次・久保田耕平 (1998) 房総半島南部のスギ・ヒノキ壮齢林におけるスギカミキリの分布. 東京大学農学部演習林報告, 99:209-218.
8. 古田公人・久保田耕平・ムシャファ・岩本則長 (1997) 人工酸性雨が大型土壌動物に与える影響とリターの有無. 東京大学農学部演習林報告, 98:9-23.
7. Kubota K. (1996) Movements of three Carabus (Ohomopterus) species and a hybrid population (Coleoptera, Carabidae). Japanese Journal of Entomology, 64:861-869.
6. Ishikawa R. and Kubota K. (1995) Geographical races of Carabus iwawakianus (Nakane) in Honshu, Japan: a tentative revision (Coleoptera, Carabidae). Bulletin of the Biogeographical Society of Japan, 50:39-50.
5. Ishikawa R. and Kubota K. (1994) Geographical races of Carabus maiyasanus Bates and C. arrowianus (Breuning) in Honshu, Japan: a tentative revision (Coleoptera, Carabidae). Bulletin of the Biogeographical Society of Japan, 49:105-128.
4. Ishikawa R. and Kubota K. (1994) Geographical races of Carabus yaconinus Bates (Coleoptera, Carabidae): a tentative revision. The Proceedings of the Japanese Society of Systematic Zoology, 50:28-40.
3. Kubota K. (1991) Natural hybridization between Leptocarabus (L.) procerulus and L. (L.) kumagaii (Coleoptera, Carabidae). Japanese Journal of Entomology, 59:323-329.
2. Kubota K. (1988) Natural hybridization between Carabus (Ohomopterus) maiyasanus and C. (O.) iwawakianus (Coleoptera, Carabidae). Kontyu, 56:233- 240.
1. Ishikawa R. and Kubota K. (1984) Carabus arrowianus (Breuning) and its new subspecies from Mie Prefecture, Japan (Coleoptera: Carabidae). Akitu, N. Ser., 65:1-6.
著書・総説・報告書・その他（主なもの）
53. 久保田耕平 (2017) 韓国のルリクワガタ属事情. 昆虫と自然, 52 (3): 21-24.
55. 久保田耕平 (2017) 3. 身近なところに隠れている大発見：クワガタムシの隠蔽種と菌嚢. 発展編・研究の世界へ, 東京大学初年次ゼミナール理科テキスト・科学の技法, 158-165. 東京大学出版社．
54. 久保田耕平 (2016) 森林生態系の分解者としての虫とそれを支える菌. 樹木医学研究, 20: 11.
53. 久保田耕平 (2015) ルリクワガタ属の種分化と分布域形成. 昆虫と自然, 50 (14): 19-22.
52. 久保田耕平 (2015) 「ミハマオサムシ」，「ウガタオサムシ」他8種. 三重県レッドデータブック2015〜三重県の絶滅のおそれのある野生生物〜，三重県．
51. 神保克明・ザールキクビツェ・大澤雅彦・福田健二・久保田耕平（2014）関東地方のさまざまな植生条件における地表徘徊性甲虫群集．千葉県生物多様性センター研究報告, 7: 101-106.
50. 久保田耕平（監修）（2012）四季の森公園の生き物たち．神奈川県立四季の森公園管理事務所（企画・編集・発行）, 27pp.
49. 久保田耕平・永幡嘉之・池田紘士・久保田典子・乙部宏・梅津和夫 (2012) 日本産ルリクワガタ属の系統と進化(4)ー遺伝子解析ー. 月刊むし, むし社, (498): 10-18.
48. 久保田耕平・久保田典子・乙部宏（2011）日本産ルリクワガタ属の系統と進化(3)ーコルリクワガタ種群の分布境界域と種間の遺伝子流動ー．月刊むし，むし社，(486): 19-24.
47. 久保田耕平・市川清・松清智洋（2010）第四章 動物相，昆虫の生態． 市民の力で湧水自然を守る・こんぶくろ池物語（NPO法人こんぶくろ池自然の森とアドバイザー会議編），49-58, 千葉日報社.
46. 久保田耕平（2010）いのちとくらしを支える生物多様性．特集1 生物多様性, 広報すずか，鈴鹿市，1325: 3.
45. 久保田耕平・久保田典子・乙部宏・永幡嘉之（2010）日本産ルリクワガタ属の系統と進化(2)ー形態解析ー．月刊むし，むし社，(474): 8-14.
44. 久保田耕平（2010）昆虫の変態と付属肢の発達．日本機械学会誌，113: 436-437.
43. 棚橋薫彦・久保田耕平（2009）クワガタムシと菌類の関係：一方的な利用と共生．昆虫と自然，ニューサイエンス社，44(11): 5-7.
42. 久保田耕平・久保田典子・乙部宏（2009）日本産ルリクワガタ属の系統と進化(1)ーコルリクワガタ種群の分類ー．月刊むし，むし社，(462): 6-21.
41. 久保田耕平・久保田典子・乙部宏（2009）新しく発見されたコルリクワガタ種群の隠蔽種について．昆虫と自然，ニューサイエンス社，44(5): 16-21.
40. 久保田耕平・久保田典子・乙部宏（2008）コルリクワガタとその近縁種の分類学的改訂について．鰓角通信，(17): 3-18．
39. 久保田耕平（2008）オサムシの種分化と種間交雑. オサムシ−飛ぶことを忘れた虫たちの魅惑−（川那部浩哉監修），八坂書房，126-138.
38. 長太伸章・曽田貞滋・久保田耕平・八尋克郎（2008）ミトコンドリアDNAから見たオオオサムシ亜属の系統関係—近畿地方の三種を中心に—. オサムシ−飛ぶことを忘れた虫たちの魅惑−（川那部浩哉監修），八坂書房，108-117.
37. 久保田耕平（2008）4. 生殖隔離と種分化. Ⅱ.六脚虫における多様性と進化，節足動物の多様性と系統（石川良輔編），裳華房，50-70.
36. 生川展行・久保田耕平ほか9名（2008）鈴鹿市のコウチュウ目．鈴鹿市の自然—鈴鹿市自然環境調査報告書—，鈴鹿市，525-691.
35. 久保田耕平 (2005) 「ミハマオサムシ」，「ウガタオサムシ」他4種. 三重県レッドデータブック2005動物，三重県．
34. 久保田耕平（2005）オサムシの移動能力. 歩く宝石オサムシ−飛べない昆虫のふしぎ発見−，滋賀県立琵琶湖博物館第13回企画展示解説書，82-83.
33. 久保田耕平（2005）オサムシの種間交雑. 歩く宝石オサムシ−飛べない昆虫のふしぎ発見−，滋賀県立琵琶湖博物館第13回企画展示解説書，78-81.
32. 長太伸章・曽田貞滋・久保田耕平・八尋克郎（2005）近畿のオサムシの系統進化. 歩く宝石オサムシ−飛べない昆虫のふしぎ発見−，滋賀県立琵琶湖博物館第13回企画展示解説書，64-67.
31. 久保田耕平 (2005) 森林無脊椎動物群集の遺伝的多様性の解明. 科学研究費補助金（基盤研究(C)(2)）研究成果報告書，91pp.
30. 久保田耕平 (2002) 分子生物学解析による森林昆虫類の個体群分化と伝播経路の解明. 科学研究費補助金（基盤研究(A)(2)）研究成果報告書，75pp.
29. 曽田貞滋・高見泰興・久保田耕平・石川良輔（2002）オサムシ類の体サイズの地理的変異：気候適応と種間相互作用がもたらすパターン. 昆蟲(N. S.)，5:88-97.
28. 久保田耕平・曽田貞滋（2001）オオオサムシ亜属における交尾器の錠と鍵. 昆虫と自然，ニューサイエンス社，36(2):15-19.
27. 久保田耕平・河田雅圭（2000）オオオサムシ亜属の交雑帯でおこっていること：形態・ミトコンドリアDNA・モデルによるシミュレーションより. SHINKA，10:8-13.
26. 久保田耕平 (2000) 書評「オサムシの春夏秋冬（曽田貞滋著）」. インセクタリウム，（財）東京動物園協会，37(12):39.
25. 久保田耕平 (1999) 昆虫類を中心とした大型土壌動物の近縁種間関係と種構成に関する生態学的研究. 科学研究費補助金（基盤研究(C)(2)）研究成果報告書，65pp.
24. Furuta K., Lee C.-Y., Kim J.-K. and Kubota K. (1998) Reflections on the management of pine needle gall midge (Thecodiplosis japonensis Uchida et Inoue) in Korea. Proceedings of international symposium “Sustainability of pine forests in relation to pine wilt and decline”, Tokyo, 170-173.
23. 久保田耕平（1998）オサムシ研究における最近の動向. 昆虫と自然，ニューサイエンス社，33(4):23-27.
22. 久保田耕平（1998）生物の多様性と進化. 農学教養ライブラリー2（東京大学農学部編・鵜飼保雄らと共著），朝倉書店， 105-126（担当部分）.
21. Musyafa, Furuta K. and Kubota K. (1997) Effects of artificial acid rain to soil macroinvertebrates (field and laboratory experiments). Proceedings of the 2nd Regional Workshop of IUFRO 7.03.08 “Forest Protection in Northeast Asia”, Seoul, 118-129.
20. Furuta K. and Kubota K. (1997) Effects of defoliation caused by Dendrolimus spectabilis on the growth of the host trees. Proceedings of the 2nd Regional Workshop of IUFRO 7.03.08 “Forest Protection in Northeast Asia”, Seoul, 101-109.
19. Kubota K. and Nakajima K. (1997) Distribution pattern of Semanotus japonicus (Coleoptera: Cerambycidae) in Young and old plantations of Cryptomeria japonica or Chamaecyparis obtusa, Japan. Proceedings of the 2nd Regional Workshop of IUFRO 7.03.08 “Forest Protection in Northeast Asia”, Seoul, 60-68.
18. 久保田耕平（1997）昆虫の種の保全と環境保全. 森林科学，20:51-55.
17. 久保田耕平（1996）「進化」，「土壌動物」ほか. 森林の百科事典（太田猛彦ら編），丸善.
16. 久保田耕平 (1995) オサムシの種間関係. 三重生物，(45):47.
15. 曽田貞滋・久保田耕平（1995）オサムシの種間交尾. 昆虫と自然，ニューサイエンス社，30(2):13-19.
14. 久保田耕平（1995）自然のレッドデータブック・三重−三重県の保護上重要な地形・地質および野生生物−（三重自然誌の会編著），三重県教育文化研究所， 108-109（担当部分）.
13. 市橋甫・久保田耕平・秋田勝己・今村隆一・生川展行（1994）三重県の甲虫類. 三重の生物，日本生物教育会第49回全国大会三重大会記念誌，172-203.
12. 久保田耕平 (1993) 「細胞の観察」，「体細胞分裂の観察」ほか. 生物の実験指導の手引き，三重生物教育会，8-17.
11. 久保田耕平 (1992) オサムシ科におけるアイソザイムの分析II. 三重生物， (42):35.
10. 久保田耕平（1991）オサムシの生活史. 昆虫と自然，ニューサイエンス社，26(5):23-26.
9.市橋甫・生川展行・久保田耕平・天春明吉・横関秀行(1991)甲虫類. 昆虫類,Ⅴ動物, 菰野町史自然編, 397-427.
8. 市橋甫・生川展行・久保田耕平（1990）甲虫類. 第4章動物，四日市市史第1巻史料編(自然)，374-408.
7.古田公人・羽澄俊裕・柴田栄・久保田耕平（1988）大佐飛山自然環境保全地域の動物群集の解析. 大佐飛山自然環境保全地域調査報告書，環境庁自然保護局，255-267.
6. 久保田耕平（1988）大佐飛山自然環境保全地域において記録された鱗翅目・鞘翅目. 大佐飛山自然環境保全地域調査報告書，環境庁自然保護局，229-239.
5. 古田公人・羽澄俊裕・柴田栄・久保田耕平（1987）利根川源流部自然環境保全地域の動物群集の解析. 利根川源流部自然環境保全地域調査報告書，環境庁自然保護局，215-232.
4. 久保田耕平（1987）利根川源流部自然環境保全地域及び周辺地域の鱗翅目・鞘翅目. 利根川源流部自然環境保全地域調査報告書，環境庁自然保護局，181-195.
3.市橋甫・宗林正人・坂部元宏・生川展行・久保田耕平・大川親雄 (1986) 三重県をタイプロカリティとする昆虫．三重昆虫談話会編，31pp.
2.市橋甫・石田勝義・久保田耕平・生川展行・秋田勝己・今村隆一（1986）鞘翅目. 三重県その自然と動物, 三重県良書出版会, 423-448.
1. 生川展行・天春明吉・今村隆一・市橋甫・久保田耕平・松井弘見・前川和則・山崎浩一（1984）比奈知地域（三重県名張市）の甲虫相. 比奈知ダム周辺昆虫類調査報告書(各論)，水資源開発公団比奈知ダム建設所，137-191.
受賞歴
日本生物地理学会賞受賞（2009年）
日本昆虫学会賞受賞（2006年）
日本昆虫学会賞受賞（2001年）